在东方神娃第二部的大结局中，魔王并没有出现。这是因为在前面的剧情中，魔王已经被主角们成功击败，他的力量也被封印在了深海之中，无法再次出现。因此，在最终的大战中，主角们只需要面对其他反派角色的挑战。

不过，尽管魔王已经被击败，他的影响仍然在整个故事中扮演着重要的角色。在战斗中，反派角色们曾试图唤醒魔王的力量，但最终被主角们所阻止。而且，在故事的结尾，主角们还需要面对魔王留下的一些后遗症，如黑暗力量的侵蚀和魔物的暴动等等。

虽然魔王没有在最终的大战中出现，但他的存在和影响仍然贯穿整个故事，为故事的发展和主角们的成长注入了更多的戏剧性。