国三电喷柴油发动机是一种高效、环保的动力源，被广泛应用于各种车辆中。然而，在长期使用中，由于各种原因，这种发动机也会出现一些常见故障。

首先，国三电喷柴油发动机的高压油泵往往是一个容易出现故障的部件。由于高压油泵需要承受高压、高温等极端环境，所以在长期使用中容易发生磨损、泄漏等问题。这些故障会导致发动机动力下降、燃油消耗增加等问题。

其次，国三电喷柴油发动机的喷油嘴也是一个常见的故障部件。由于喷油嘴需要承受高压、高温等极端环境，所以在长期使用中容易发生堵塞、漏油等问题。这些故障会导致发动机启动困难、动力下降、油耗增加等问题。

另外，国三电喷柴油发动机的进气系统也是一个容易出现故障的部件。由于进气系统需要吸入大量空气，所以在长期使用中容易产生积碳、污垢等问题。这些故障会导致发动机动力下降、燃油消耗增加等问题。

最后，国三电喷柴油发动机的电控系统也是一个容易出现故障的部件。由于电控系统需要控制发动机的各种参数，所以在长期使用中容易出现电路短路、传感器故障等问题。这些故障会导致发动机启动困难、动力下降、排放不达标等问题。

综上所述，国三电喷柴油发动机在长期使用中会出现各种故障，需要及时检修和维护。车主可以定期进行保养和检查，及时更换易损件，避免故障的发生。