近年来，房地产市场一直备受关注，其中二套房政策更是备受争议。而在这个话题中，40年公寓是否算作二套房也成为了广受关注的话题。

首先，我们来了解一下40年公寓的概念。40年公寓是指在1988年前购买的住房，按照当时的政策，购房者只能享受40年的产权。在这之后，购买者需要重新交纳土地出让金等费用，才能续期产权。

那么，40年公寓是否算作二套房呢？在当前的政策下，对于已经拥有一套住房的购房者，购买第二套住房需要缴纳相应的税费和社保等费用。然而，对于40年公寓来说，由于其产权期限的限制，很多购房者并不认为其算作二套房。

但是，从法律角度出发，40年公寓在购买时已经享有了房屋所有权，因此在购买第二套住房时，也应该被视为已经拥有了一套住房。而且，政策法规也没有明确规定40年公寓不算作二套房。

因此，我们可以得出结论，40年公寓在购买第二套住房时，应该被视为已经拥有一套住房，需要按照相关政策缴纳相应的税费和社保等费用。

总之，40年公寓是否算作二套房，这个问题并没有一个明确的答案。不过，从法律和政策角度出发，购买第二套住房时需要缴纳相应的费用是不争的事实。因此，在购买第二套住房时，购房者应该按照相关政策规定，合法合规地进行购买。