高等院校作为我国教育体系的重要组成部分，一直以来都在为培养优秀人才做出贡献。然而，由于社会经济发展的不平衡和个人家庭背景的差异，一些学生面临着经济困难的问题，这也成为了影响他们学习和发展的重要因素。因此，高等院校为了帮助这些家庭经济困难的学生，设置了相应的认定申请机制。

首先，对于高等院校家庭经济困难学生认定申请的理由，主要是基于学生个人及其家庭情况的考虑。例如，学生家庭经济状况的困难程度、家庭成员的收入情况、家庭债务负担以及家庭成员的医疗和教育支出等方面都是需要认真考虑的因素。通过对这些因素的全面评估，可以帮助高校更准确地判断学生是否具备家庭经济困难的情况，从而为这些学生提供更加有针对性的帮助和支持。

其次，对于家庭经济困难学生认定申请的理由，高等院校还需要关注学生个人的学习和发展情况。例如，学生是否拥有优秀的学习成绩、是否积极参加校内外活动、是否有特殊的社会贡献等方面都是需要认真考虑的因素。通过对这些因素的评估，可以更好地了解学生的个人能力和潜力，为他们提供更加全面的支持和帮助。

最后，对于高等院校家庭经济困难学生认定申请的理由，还需要充分考虑社会公平和教育公平的原则。高等院校应该秉持着公平、公正、透明的原则，遵循着学生发展与社会需求相结合的原则，为家庭经济困难学生提供更加公平和优质的教育资源和服务。

综上所述，高等院校家庭经济困难学生认定申请的理由是多方面的，需要从学生家庭经济状况、个人学习和发展情况以及社会公平和教育公平等方面进行全面考虑。只有这样，才能更好地为家庭经济困难学生提供更加有针对性和个性化的支持和帮助。