南京飞机退票手续费是按照机票价格的一定比例进行扣除的。一般来说，如果在起飞前72小时内退票，手续费会比较高，一般在机票价格的20%左右；如果在起飞前72小时以上退票，手续费相对较低，一般在机票价格的10%左右。

需要注意的是，不同的航空公司对退票手续费的规定可能有所不同。因此，在退票之前，最好先去官方网站或客服咨询了解该航空公司的具体规定，以免造成不必要的损失。

此外，如果是因为航班取消或延误等原因导致的退票，一般不收取手续费。但需要提供相关证明材料，如航空公司通知或机场公告等，以便顺利退票。

总之，退票手续费的高低取决于退票时间以及航空公司的规定。在退票前，最好先了解相关规定，避免不必要的损失。