内质网和高尔基体都是细胞内的重要细胞器，但它们的作用有所不同。

内质网（Endoplasmic reticulum，ER）是指一种复杂的膜系统，包括粗面内质网和平滑内质网。粗面内质网上有许多附着的核糖体，主要负责蛋白质的合成和折叠。而平滑内质网则具有多种功能，如合成脂类和类固醇、解毒等。内质网还可以对蛋白质进行修饰，如糖基化、磷酸化等，以及参与细胞自噬、细胞分裂等重要生理过程。

而高尔基体（Golgi apparatus）则是一种由平面膜组成的细胞器，通常被称为“分泌的工厂”。高尔基体主要负责蛋白质和脂质的运输和修饰，将它们从内质网分泌到细胞外或其他细胞器内。高尔基体还可以对蛋白质进行修饰，如糖基化、磷酸化等，以及参与膜蛋白的合成和转运等重要生理过程。

因此，内质网和高尔基体虽然在一定程度上有重叠的功能，但它们的主要作用区别在于：内质网主要负责蛋白质合成和修饰，而高尔基体则主要负责蛋白质和脂质的运输和修饰。二者相互配合，共同参与细胞的生理和代谢过程。