国民党军统和中统都是中国历史上的特殊政治机构，但两者有着明显的区别。

首先，国民党军统是国民党政府下属的秘密情报机构，成立于1927年。其主要职责是对抗共产党和其他政治敌对势力，进行情报收集、破坏、监视和处决等活动。在整个国民党统治时期，军统一直是一个极度秘密和残酷的机构，其手段和手法常常引起社会公愤和国际谴责。

而中统则是台湾国家安全机构的前身，成立于1949年。其职责是维护国家安全和对抗中国大陆，包括情报收集、反间谍、保卫领土和打击恐怖主义等方面的工作。中统的存在和活动也受到了国际社会的关注和批评，但在台湾地区政治体制下，其合法性和合理性得到了一定的认可和支持。

其次，在组织结构和领导层面上，国民党军统和中统也有很大的不同。国民党军统由蒋介石亲自领导，其组织结构庞大且极为复杂，包括了多个分支机构和特殊部队。而中统则是一个相对简单和集中的机构，直接归属于台湾行政机构内阁，由总统任命负责人。

最后，国民党军统和中统的历史和作用也有所不同。国民党军统在整个国共内战和国民党统治时期，对中国的政治、经济、文化和社会都产生了深远的影响，其暴力和危害也造成了无数的人员伤亡和社会动荡。而中统则是一个相对年轻和现代化的机构，在台湾的政治历史和国际关系中也发挥了重要的作用，但其作为一个安全机构的性质和任务，也经常受到社会和媒体的监督和批评。

总之，国民党军统和中统虽然都是中国历史上的特殊政治机构，但在其职责、组织结构、作用和历史意义上都有着明显的差异。对于中国的政治和社会而言，理性和客观地认识和评价这些机构，不仅有助于历史的正视和反思，也是推动中国现代化和民主化进程的重要一步。