原子半径是指原子核与电子外层电子轨道最外层电子距离原子核的距离。氦的原子半径为0.31埃，这个值是所有元素中最小的。那么，为什么原子半径第二小的元素不是氦呢？

事实上，原子半径第二小的元素是氢。氢的原子半径为0.37埃。虽然氦的原子序数比氢大，但是氦的原子结构比氢更加复杂。

氦的原子结构是1s2，也就是说在氦的外层电子轨道中只有2个电子。这两个电子都处于s轨道中，电子云的形状是球形的。由于电子云的形状是球形的，因此氦的原子半径非常小。

相比之下，氢的原子结构是1s1，也就是说在氢的外层电子轨道中只有1个电子。由于氢的原子核只有一个质子，而且电子云的形状也是球形的，因此氢的原子半径比氦要大一些。

此外，原子半径不仅仅与电子数目有关，还与原子核的电荷数目有关。原子核的电荷数目越大，它对外层电子的吸引力也就越大，从而使得原子半径变小。氦的原子核中有2个质子，而氢的原子核只有1个质子，因此氦的原子半径比氢更小。

综上所述，虽然氦的原子序数比氢大，但是由于氦的原子结构更加复杂，原子核中的质子数目更多，因此氦的原子半径比氢更小。因此，原子半径第二小的元素是氢，而不是氦。