《海洋深处1999》是一部科幻电视剧，讲述了一支名为“海底探索者”的深海探险队在未来的海洋深处发生的一系列神秘事件。故事发生在1999年，当时人类已经能够探索到深海的最底层，但对于海底的神秘世界仍然一知半解。

海底探索者号是一艘先进的深海探险船，它的使命是探索深海并进行科学研究。船上的乘员包括船长、科学家、技术人员和工程师。在探索的过程中，他们遭遇了一系列神秘事件：一艘外星飞船被发现，一种奇怪的病毒让船员们陷入了危险，船员们还发现了一个神秘的水下基地。

在这个神秘的基地里，他们遇到了一群来自未知星球的智慧生物——深海人。深海人拥有超凡的智慧和技术，他们的存在引起了船员们的极大兴趣。然而，深海人却十分警惕人类的存在，并试图将船员们赶出基地。

在与深海人的交流中，船员们逐渐了解到深海人的真正意图：他们试图保护整个海洋生态系统，防止人类的破坏。深海人认为人类的存在对海洋生态系统造成了严重威胁，因此试图通过各种手段阻止人类的探险行动。

最终，在船员们与深海人的交流中，他们意识到彼此的存在对于整个地球的生态系统都是必不可少的。在双方的合作下，船员们成功解决了病毒危机，并与深海人达成了合作协议。这部科幻电视剧通过惊险刺激的剧情，展示了人类与海洋生态系统之间的复杂关系，也呼吁人们应该更加重视保护海洋环境。