南京市的水费计算方式是根据居民家庭的用水量来计算的。南京市居民家庭用水的计费标准分为两种，一种是阶梯式计费，另一种是单价计费。

阶梯式计费是指根据居民家庭用水量的不同来分段计费。南京市的阶梯式计费分为3个档次，前20吨水按每吨2.5元计算，20-30吨水按每吨3.5元计算，超过30吨水按每吨4.5元计算。

单价计费是指无论居民家庭用水量多少，都按照同一个单价来计费。南京市的单价计费标准为每吨3.5元。

在南京市，居民家庭的水费是由水费基础费和用水量费组成的。水费基础费是指每户居民家庭每月需要缴纳的固定费用，用于维护水管道和水厂的基础设施。用水量费是指居民家庭按照用水量计算的费用。

需要注意的是，南京市的水费计算方式可能会根据实际情况有所调整，因此居民家庭需要关注南京市水务部门的相关通知和公告，及时了解最新的水费计算标准。

总之，南京市居民家庭的水费计算方式是比较公正和合理的，居民家庭只要按照实际用水量缴纳水费，就能够享受到高质量的自来水服务。