新车上牌需要办理汽车合格证，那么这个合格证会交到哪个部门呢？

首先，我们需要知道汽车合格证是由国家质量监督检验检疫总局颁发的，它是证明汽车符合国家强制性标准的证书。在汽车生产厂家生产完成后，必须通过质量检验并获得合格证才能上市销售。

当新车销售到消费者手中后，消费者需要到当地车辆管理所进行车辆注册和上牌。在办理上牌手续时，消费者需要提供汽车合格证。此时，消费者需要将汽车合格证交给车辆管理所的机动车登记处进行审核和备案。

机动车登记处会对汽车合格证进行审核，确认汽车是否符合国家强制性标准。如果汽车合格证审核通过，机动车登记处会将汽车信息录入机动车登记簿，并颁发机动车行驶证和号牌。

需要注意的是，汽车合格证是非常重要的证明文件，消费者在购车时一定要注意保存好合格证，避免丢失或损坏。如果汽车合格证丢失或损坏，消费者需要到销售商处重新申请补办。

综上所述，新车上牌汽车合格证会交到机动车登记处进行审核和备案。消费者在购车时需要注意保存好合格证，以便顺利办理上牌手续。