南京是一座历史悠久的城市，有着众多的名胜古迹和美食，非常适合进行短期旅游。下面介绍一下南京二日游的最佳路线。

第一天：

早上，到达南京后先前往南京夫子庙。这里是南京的文化中心，有着许多古老的建筑和美食街。游客可以欣赏古建筑、品尝特色美食和购买纪念品。

中午，可以前往南京市中心的老门东区域，这里有着许多的小吃和餐厅。推荐品尝南京的小吃美食，如鸭血粉丝汤、狮子头、桂花糕等。

下午，前往南京的标志性建筑——中山陵。这里是中国现代历史的见证，游客可以参观中山陵陵园、中山陵博物馆和中山陵陵寝，了解中国现代史和孙中山先生的生平事迹。

晚上，可以去到夫子庙附近的秦淮河畔，欣赏美丽的夜景和灯笼秀。

第二天：

早上，前往南京的另一标志性建筑——明孝陵。这里是明朝第二位皇帝朱祁钰和皇后的陵墓，风景秀丽，气势雄伟。

中午，前往南京的美食天堂——秦淮路。这里有着许多著名的南京小吃和餐厅，如鸭血粉丝汤、扬州炒饭、蚂蚁上树等。

下午，可以前往南京博物院，了解南京的历史和文化。南京博物院是中国最大的博物馆之一，收藏着许多珍贵的文物和艺术品。

晚上，可以到南京市中心的夫子庙附近的酒吧街，享受夜生活。

以上是南京二日游的最佳路线，可以在短期内深度感受南京的文化和历史。