国民教育序列本科和普通高等院校本科是两种不同的本科教育模式，其区别主要在于以下几个方面。

首先，国民教育序列本科是由教育部直接管理的一种本科教育类型，其培养目标是培养高素质的创新型、应用型、复合型人才，具有很强的专业性和实践性。而普通高等院校本科则是由各地省级教育主管部门管理的本科教育类型，其培养目标是培养具有专业知识和技能的应用型人才。

其次，国民教育序列本科的课程设置和教学模式更加注重实践应用。在国民教育序列本科中，学生需要完成一定的实践性课程和实践性任务，如实践性教学、实践性科研、实践性创新等，以提高学生的实践能力。而普通高等院校本科则注重理论课程的学习，重视学生的理论基础。

最后，国民教育序列本科的教师队伍和教学资源更加优质，更具有国际化水平。国民教育序列本科注重引进海外教师和国际先进教学资源，以提高教学质量和国际竞争力。而普通高等院校本科则相对较为局限，教师队伍和教学资源相对不足。

综上所述，国民教育序列本科和普通高等院校本科在培养目标、课程设置和教学模式、教师队伍和教学资源等方面存在着差异。学生在选择本科教育类型时，应根据自己的兴趣爱好、职业规划和未来发展方向等因素进行选择。