神农本草经和本草纲目是中国古代两部非常重要的药学经典。神农本草经是中国最早的一部药物学著作，也是我国最早的一部农业著作之一，被誉为中华医学的起源。本草纲目则是明代李时中所编写的一部巨著，是中国古代药学史上最为重要的一部著作之一，对中国药学的发展产生了极为深远的影响。

首先，神农本草经和本草纲目在编写时间上有很大的差异。神农本草经据传是在远古时期，由伏羲所著，后由神农氏所修订的一部药物学著作，其时间跨度至少有三千年之久。而本草纲目则是在明代李时中所编写的，距今已有五百多年的历史。

其次，神农本草经和本草纲目在内容上也有很大的不同。神农本草经主要介绍的是植物药物，其中大量的药物都是中药材的原型，如黄芩、桑叶等。而本草纲目则对中药、动物药、矿物药等进行了全面的介绍，涵盖了更为广泛的范围。

此外，神农本草经和本草纲目在药理学和药物治疗方面也存在差异。神农本草经主要以药用植物的形态、产地、采集、生长环境、药用部位、药理作用等进行描述，对于药物的药理作用和治疗方面并没有进行详细的探讨。而本草纲目则对中药材的药理作用和药物治疗方面进行了更为详细的研究和探讨，是一部更加完善的药学著作。

总之，神农本草经和本草纲目都是中国古代药学史上非常重要的著作，它们都对中国药学的发展和演变产生了深远的影响。不同的时代和背景下，这两部著作都在各自的领域做出了重要的贡献，成为了中华医学文化中不可或缺的一部分。