扣12分重考科一需要支付的费用是由不同的因素决定的。首先，每一次科一考试的报名费用是相同的，通常为90元人民币。因此，如果您第一次考试不及格，需要重考，则需要再次支付这个费用。

其次，如果您在第一次考试中扣了12分，那么您需要参加一次补考，这将增加您的费用。通常情况下，补考的费用为60元人民币左右，这将再次增加您的总费用。

除此之外，您还需要考虑其他可能的费用，例如教练费用和车辆租赁费用。如果您需要更多的训练和指导，那么您可能需要支付更多的教练费用。同样，如果您需要租赁汽车来进行训练和考试，那么这也将增加您的总费用。

总的来说，扣12分重考科一需要支付的费用可能会因个人情况而有所不同。然而，考虑到报名费用、补考费用和其他可能的费用，您需要准备至少几百元人民币来完成这个过程。因此，在考试前，您应该充分考虑这些费用，并做好相应的预算，以确保您可以顺利完成考试。