苹果手机在百度网盘下载的文件会存放在手机的'文件'应用里。用户下载的文件可以选择保存在手机本地或者百度网盘中。如果选择保存在手机本地，文件会自动保存在'文件'应用的'下载'文件夹中。如果选择保存在百度网盘中，用户可以通过打开百度网盘应用，在'下载'选项卡中找到已下载的文件进行管理和查看。值得注意的是，如果用户的手机存储空间不足，下载的文件可能会自动保存在百度网盘中，用户需要手动将其移动到手机本地或者删除不需要的文件以释放空间。