自来也是《火影忍者》中的重要角色之一，他被誉为“三忍”之一，实力非常强大。但是在与佩恩的战斗中，自来也却不敌佩恩，让很多观众感到困惑。那么，自来也为什么打不过佩恩呢？

首先，佩恩是“晓组织”的领袖，他的实力非常强大。佩恩掌握着“六道之力”，这是一个极为强大的忍术，可以让他轻松地控制重力、时间和空间等因素。这让佩恩在战斗中拥有极大的优势，自来也很难对抗。

其次，自来也在战斗中受到了伤势的影响。在与佩恩的激战中，自来也不幸中了佩恩的“神秘之术”，身体被毒素侵蚀，实力大减。这让自来也在战斗中处于劣势，无法发挥出自己的真正实力。

最后，自来也在战斗中没有找到佩恩的弱点。佩恩的实力虽然强大，但是并不是没有破绽。如果自来也能够找到佩恩的弱点，或许就有机会打败他。但是自来也在战斗中并没有找到这个机会，这让他无法发挥出真正的实力。

综上所述，自来也为什么打不过佩恩，主要是因为佩恩实力太强大，自来也受伤且未能找到佩恩的弱点。但是即便如此，自来也在战斗中也表现出了坚强的意志和勇气，这也是他作为忍者的重要品质。