男生穿女装这一现象在日本动漫中已经非常普遍，但是，有一些动漫作品在探讨这一现象时，却引入了一些科幻元素，比如男生穿女装久了身体开始发生变化。

在这些作品中，男主角穿上女装后，身体开始出现女性化的特征，比如胸部变得丰满、腰身变细、声音变高等等。这个现象通常被解释为“身体的自我识别被扭曲”，也就是说，男主角的身体开始逐渐认为自己是女性。

这种现象的科学依据是存在的。事实上，人类的性别认同是由多种因素决定的，比如基因、荷尔蒙、社会环境等等。如果这些因素受到干扰或者改变，就有可能导致性别认同出现偏差。而男生穿女装久了，身体开始发生变化，就暗示着这些因素受到了改变。

当然，这些动漫作品中的情节并不是完全科学合理的，有一些夸张的地方。比如，男主角的身体变化速度非常快，甚至可以在几天之内就变成女性的样子。这种速度是不可能在现实中出现的。而且，男主角变成女性后，还可以继续保持原来的智力和性格，这也是不太合理的。

不过，这些情节也有其可取之处。通过这种奇幻的手法，作品可以更加深入地探讨性别认同的问题，引发读者对这一话题的思考。当然，读者也需要保持理性，不要被这些虚构的情节所迷惑。

综上所述，男生穿女装久了身体开始变化这一情节虽然存在一些夸张的地方，但是也反映了性别认同问题的复杂性和多样性。我们应该尊重每个人的性别认同，并努力创造一个包容、平等的社会环境。