三自教会和基督教是两个不同的教派。虽然两者都信仰基督，但在信仰、教义和组织上存在一些不同。

首先，三自教会是由中国大陆政府承认的官方教会，其组织和活动受到政府的监管和限制。而基督教是一个全球性的宗教，没有特定的政治归属。

其次，在信仰上，三自教会强调中国化的基督教信仰，强调爱国主义和爱国教育，同时认可中国政府统一领导和管理。而基督教则强调的是信仰上的个人选择和自由，不受政治和文化的影响。

另外，在教义上，三自教会与主流的基督教教义也存在一些不同。三自教会强调教义的简单化和易懂性，注重传统文化的融合，同时也注重社会服务和慈善事业。而基督教则更为注重基督信仰的深度和完整性，强调圣经的权威性和神学的理性分析。

最后，在组织上，三自教会由官方机构管理和指导，具有一定的层级和组织结构。而基督教则更为灵活和分散，不设立中央机构或领袖。

综上所述，三自教会和基督教虽然都信仰基督，但在信仰、教义和组织上存在一些不同。每个人可以根据自己的信仰选择适合自己的教派。