《奇门遁甲》第二季故事紧扣第一季结尾，讲述了主角陈晨（张一山饰）与他的团队在探索古墓过程中，被卷入了一个更加危险的阴谋中。

在寻找古墓的过程中，陈晨结识了一个神秘女子——沈雪（杨紫饰）。沈雪身上的秘密引起了陈晨的注意，他开始对沈雪进行调查，并在沈雪的帮助下，发现了整个事件的真相。

原来，一群神秘组织正计划利用古墓中的秘密力量，掌控整个世界。陈晨及其团队的任务就是阻止这一阴谋的发生。在经历了一系列惊险的冒险后，陈晨和他的团队终于找到了秘密力量的来源，并成功阻止了阴谋的发生。

除了故事情节的惊险刺激，第二季还加入了更多的科技元素，让整个故事更加紧凑有趣。同时，主演张一山和杨紫的演技也得到了更进一步的提升，让观众们更加投入到剧情中。

总的来说，第二季《奇门遁甲》不仅延续了第一季的精彩故事，还在故事情节和演员表现上有了更进一步的提升，让观众们更加期待第三季的到来。