醋酯纤维和聚酯纤维是两种常见的合成纤维材料，它们具有不同的化学结构和物理性质。

首先，醋酯纤维是由纤维素和醋酸经过化学反应得到的，它的化学结构中含有大量的醋酸基团。而聚酯纤维则是由聚酯化合物经过聚合反应得到的，它的化学结构中含有大量的酯基团。

其次，在物理性质方面，醋酯纤维具有良好的亲水性和透气性，同时也比较柔软，适合用于制作纺织品和医疗用品等。而聚酯纤维则具有较高的强度和耐热性，适合用于制作工业用品和高档服装等。

此外，醋酯纤维和聚酯纤维的生产工艺和加工方法也有所差异。醋酯纤维的生产工艺比较简单，加工方法也较为容易，而聚酯纤维的生产工艺则相对较为复杂，加工难度也较大。

综上所述，醋酯纤维和聚酯纤维虽然都是合成纤维材料，但它们的化学结构和物理性质存在较大的差异，适用于不同的领域和用途。因此，在选择合适的纤维材料时，需要根据具体需求来进行选择。